Родился 30 января 1904 г. в с. Березна Киевской губ.

Доктор физико-математических наук (1943), действительный член АН Украинской ССР (1948).

Работал препаратором в физическом кабинете Белоцерковского механического техникума, был мастером по точным оптическим приборам (1920–1924). Окончил механический факультет Киевского политехнического института (1930), аспирантуру Ленинградского физико-технического института (1933). Заведовал отделом фазовых превращений Уральского физико-технического института (1933–1948), кафедрой рентгеноструктурного анализа, рентгеновской лабораторией Уральского университета (1937–1947). Участвовал в запуске первого в СССР бетатрона (Свердловск, 1946).

Директор (1950–1957), заведующий лабораторией рентгеновских и гамма-лучей (1957–1963), заведующий лабораторией физики высоких энергий (1963–1976) Ленинградского физико-технического института. Заведующий кафедрой ядерной физики Ленинградского политехнического института (1951–1969).

Выполнил большой цикл исследований по изучению свойств упорядочивающихся сплавов и фазовых превращений в чистых металлах и сплавах. Работы А. П. Комара по фотоядерным реакциям стали вкладом в понимание механизма взаимодействия гамма-квантов с ядрами. Руководил разработкой первой программы исследований на синхроциклотроне с энергией 1 ГэВ. Опубликовал более 140 работ в области физики твердого тела и атомного ядра. Помог подготовить более 20 кандидатских и докторских диссертаций.

Удостоен Сталинской премии за участие в создании электронных ускорителей (1951).