Родился 1 августа 1940 г. в Свердловске.

Доктор физико-математических наук (1989), профессор (1991).

Окончил физический факультет Уральского университета (1962).

Работает в Уральском университете с 1965 г.: ассистент, старший преподаватель, доцент, профессор кафедры оптики полупроводников (ныне – компьютерной физики).

Подготовил и читает основные специальные курсы по физике диэлектриков, теории симметрии. Активно занимается учебно-методической работой. В течение многих лет является председателем методической комиссии физического факультета университета.

Специалист в области физики твердого тела и спектроскопии кристаллов.

Развил микроскопический подход к расчету статических, динамических и спектроскопических характеристик кристаллов, активированных элементами переходных групп, позволяющий установить связь физических свойств кристаллов с микроскопическими характеристиками d-иона в кристалле. Усовершенствовал метод симметрийного анализа спектров электронного парамагнитного резонанса (ЭПР) в кристаллах, претерпевающих структурные фазовые переходы. Выполнил цикл работ по интерпретации оптических и ЭПР-спектров обменно-связанных комплексов в кристаллах.

Под руководством А. Е. Никифорова защищено 12 кандидатских и три докторские диссертации.

В 1982 г. А. Е. Никифорову, а также В. И. Черепанову, А. И. Кроткому, С. Ю. Шашкину присуждена премия Уральского университета за лучшую научную работу.

Почетный работник высшего профессионального образования Российской Федерации (2005).